Afhüppe begann seine berufliche Karriere 1999 als Hauptstadtkorrespondent der "WirtschaftsWoche". Von 2004 an war er in gleicher Position beim Nachrichtenmagazin "Der Spiegel" tätig, bevor er 2006 ins Berliner "Handelsblatt"-Büro wechselte. Bei der Wirtschaftszeitung wurde der Diplom-Volkswirt 2011 stellvertretender Chefredakteur, 2015 Co-Chefredakteur, 2016 alleiniger Chefredakteur und 2018 assoziiertes Mitglied der Geschäftsführung.
 
Im März 2021 ging Afhüppe zur Deutschen Bank, von der er sich Ende 2023 als Global Head of Political Affairs verabschiedete. Im Herbst 2024 wurde er Leiter Unternehmenskommunikation bei der Neobank N26, die er ein Jahr später wieder verließ.


Künftig arbeitet der 54-Jährige für die zur Unternehmensgruppe RTL Deutschland zählenden Titel "stern" und "Capital". Als Senior Editor soll Afhüppe dabei helfen, die Wirtschaft- und Finanzberichterstattung der Zeitschriften auf allen Kanälen auszubauen.

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